Рис. 2. Вторичная структура РНК поспивироидов (вверху) и авсунвироидов (внизу).
Различают два семейства - Pospiviroidae и Avsunviroidae. Они названы по сокращению первых найденных представителей: Potato spindle tuber viroid (PSTVd) (вироид веретеновидности клубней картофеля) и Avocado sunblotch viroid (ASBVd) (вироид солнечной пятнистости авокадо). РНК вироидов сем. Pospiviroidae отличается наличием центральной консервативной части нуклеотидной последовательности и отсутствием в составе генома рибозимов типа hammerhead. При электроно-микроскопическом исследовании эти вироиды выглядят как палочки с соотношением длинной и короткой осей примерно 20:1 (рис.1 и 2). РНК вироидов сем. Avsunviroidae, напротив, не имеют центральной консервативной части, но имеют в составе генома рибозимы типа hammerhead. Вторичная структура их РНК характеризуется наличием нескольких протяженных шпилек (рис.2)
Классификация вироидов основана на анализе нуклеотидной последовательности. Если уровень гомологии выше 90%, то сравниваемые вироиды относят к одному виду.
Рис.1. Электронная микрофотография посповироида.
Вироидные РНК имеют размер 246-375 нуклеотидов. Они обладают отчетливо выраженной вторичной структурой. Не менее двух третей оснований в их составе может быть спарено за счет комплементарных взаимодействий. В результате образуются протяженные участки из двойной спирали, перемежающиеся небольшими петлями из неспаренных нуклеотидов или несколько протяженных шпилек. Вироиды очень устойчивы к воздействию физико-химических факторов. Сложная вторичная структура, обеспечивает им защиту молекулы от нуклеаз. Вироидная РНК не кодирует белков. Ее репликация осуществляется клеточным - ДНК-зависимой РНК-полимеразой II. Репликация вироидов осуществляется по принципу «катящегося кольца» (rolling circle).
Вироиды были открыты Теодором О. Динером в 1971 году. Он же предложил термин «вироид». Первым идентифицированным вироидом был вироид веретеновидности клубней картофеля (potato spindle tuber viroid, PSTVd). Вироиды являются патогенами растений. Описано 27 вироидов, поражающих картофель, цитрусовые, яблони, персики, кокосовую пальму, хмель и другие сельскохозяйственные культуры.
Вироиды - инфекционные агенты, представляющие собой ковалентно замкнутую циркулярную РНК.
Вироид - Энциклопедия - Фонд знаний «Ломоносов»
Комментариев нет:
Отправить комментарий